La casona perteneció a Doña Paula Guerrero y Dávila, fue una distinguida dama de la aristocracia queretana del siglo XVIII. Contrajo matrimonio con Don Juan Antonio de Urrutia y Arana, Marqués de la Villa del Villar del Águila, reconocido por impulsar la construcción del emblemático Acueducto de Querétaro. Su magnífica residencia que hoy se conoce como Casa de la Marquesa, es desde donde administró parte del patrimonio familiar que ayudó a la construcción de obras muy importantes para Querétaro ejecutadas por su esposo. Su figura quedó ligada para siempre a esta casona, uno de los máximos ejemplos de la arquitectura barroca civil en Querétaro y un símbolo del esplendor novohispano de la ciudad.